Estudio "Whole-Genome sequencing and comparative genomics of Mycobacterium spp. from farmed Atlantic and coho salmon in Chile" fue recientemente publicado.
«Según un análisis filogenético reciente, algunas cepas de Mycobacterium salmoniphilum (Msal), que son el principal culpable de los brotes bacterianos en la acuicultura de peces de agua dulce, se han asignado a una rama separada que contiene Mycobacterium franklinii (Mfra), otra especie que causa infecciones en humanos», señala estudio.
Un estudio desarrollado por los investigadores Rudy Suarez, Karina Kusch, Claudio D. Miranda, Tianlu Li, Javier Campanini, Phani Rama Krishna Behra, Luis Aro, Alexis Martínez, Marcos Godoy y Daniel A. Medina aisló «cuatro especies de Mycobacterium, cepas de cultivos de agua dulce de salmón del Atlántico y coho en Chile y realizó la secuenciación del genoma completo para una caracterización genómica profunda».
Así fue como describieron la patología macroscópica e histopatología de los brotes. Se realizaron varios análisis bioinformáticos utilizando los genomas de estos cuatro aislados de Mycobacterium junto con los de las cepas Msal, cuatro cepas similares a Msal y una cepa Mfra, además de otros 17 genomas de Mycobacterium disponibles públicamente.
«Encontramos que tres aislamientos se agrupan en la rama Msal, mientras que un aislado se agrupa con las cepas similares a Mfra / Msal. Además, evaluamos la presencia de genes de virulencia y resistencia a los antimicrobianos y observamos que los cuatro aislados estaban estrechamente relacionados con los taxones Msal y similares a Msal y portaban varios genes de resistencia y virulencia a los antimicrobianos que son similares a los de otros miembros patógenos del clado Mycobacterium», explica el estudio.
«La secuenciación del genoma completo confirmó que tres de los aislamientos: myc161, myc182 y myc162, pertenecían a la especie Msal, mientras que el aislado myc151 estaba estrechamente relacionado con la nueva rama filogenética similar a Mfra / Msal descrita en estudios anteriores, donde los autores identificaron diferencias genómicas significativas entre las cepas», detallan.
Asimismo, explican que estas cepas similares a Msal pertenecen a una sola especie según su puntuación ANI. De acuerdo con los datos reportados previamente, observamos que las cepas de Mfra mostraban patrones que eran similares, pero no idénticos, a los de las cepas de tipo Msal en términos de sus secuencias de ARNr 16S, genoma completo y núcleo y pangenoma como la Cepas de tipo Msal»
Por lo tanto, este es el primer estudio que reporta una especie recientemente propuesta, que potencialmente causa micobacteriosis en salmónidos, perteneciente al grupo similar a Mfra / Msal de un sistema de reproducción de agua dulce de Chile, destacando la necesidad de monitorear estas enfermedades relacionadas con micobacteriosis en entornos de acuicultura.
«En conjunto, este trabajo destaca la importancia de revisar las clasificaciones anteriores de especies infecciosas de Mycobacterium utilizando herramientas científicas novedosas y varios enfoques bioinformáticos…nuestros hallazgos allanan el camino para una mayor investigación y monitoreo de este género bacteriano como un posible agente etiológico de una enfermedad emergente, a saber, la micobacteriosis en los sistemas de acuicultura», concluyen.
Puede acceder al estudio aquí
